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​利用の流れ

お問い合わせ

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​最適なアプローチを提案

局所領域遺伝子発現解析

局所領域遺伝子発現解析
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微小組織採取装置を使用し、
微小組織切片の採取・回収を行う。
採取した切片においてRNA-seqを行うことも可能。

Xenium

Xenium
Xenium
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サブセルラーの解像度の
遺伝子発現空間解析が可能。
複雑な組織、近傍領域、
細胞間相互作用を理解し、
他の空間的オミックス、組織、
形態に関する情報と
の統合解析が可能。

蛍光物質のついたプローブをハイブリダイズさせ、
Xenium Analyzer​で蛍光を画像ベースで測定します。

新鮮凍結切片またはFFPEサンプルに対応

コンサルティング

Visium

Visium
Visium

サブセルラーの解像度の遺伝子発現空間解析が可能。
複雑な組織、近傍領域、細胞間相互作用を理解し、
他の空間的オミックス、組織、形態に関する
情報との統合解析が可能。

蛍光物質のついたプローブをハイブリダイズさせ、Xenium Analyzer​で蛍光を画像ベースで測定。

新鮮凍結切片またはFFPEサンプルに対応。

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インフォマティクス解析

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Chromium
(scRNA-seq)

Chromium
(scRNA-seq)
Chromium (scRNA-seq)

ハイスループットなシングルセル解析が可能。
細胞の集団および状態に関する詳細な解析が可能。

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Phenocycler

PacBio Revio
(ロングリードシーケンス)
Phenocycler

組織微小環境における
空間的シングルセル解析システム

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凍結切片、FFPE切片を用いて
50色以上のタンパク質の蛍光免疫染色が可能。
シングルセルの解像度でイメージングが可能。

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PacBio Revio (ロングリードシーケンス)

Revio システムを用いた
HiFi シークエンシングにより、
数万塩基のHiFiリードを取得。
卓越したシーケンス精度であり、
DNA のメチル化の直接検出や
配列中のコンテクストを問わず

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均一なカバレッジのリードを取得可能。
エピジェネティックな解析やリピート配列の解析やアイソフォーム解析が可能である。加えて、
ターゲットシークエンシングが可能。

PacBio Revio
(ロングリードシーケンス)

PacBio Revio
(ロングリードシーケンス)

​結果報告

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​コンセプト

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早稲田大学空間オミックス解析研究拠点
Center for Spatial Omics Analysis Rearch (CESOAR)

東京都 新宿区 早稲田 鶴巻町 513 121号館

CESOAR-support[at]list.waseda.jp

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